Hrvatska kinoteka utemeljena je kao nacionalni filmski arhiv Zakonom o kinematografiji iz 1976. godine. Od 1979. godine djeluje kao zasebni odjel u sastavu Hrvatskoga državnog arhiva. Hrvatska kinoteka prikuplja domaću filmsku proizvodnju, strane filmove distribuirane i prikazivane u Hrvatskoj, popratno filmsko gradivo koje dokumentira nastanak filmskoga djela (scenarije, knjige snimanja, filmske fotografije, filmske plakate i druge reklamne publikacije), zvučne zapise na različitim nosačima, kao i projekcijsku i snimateljsku filmsku tehniku, te čuva, obrađuje i provodi mjere zaštite i restauracije audiovizualnoga gradiva kao dijela ukupnoga arhivskog gradiva Hrvatskoga državnog arhiva. Od osnutka do danas prikupljeno je oko 15 000 naslova domaće i strane filmske produkcije radi očuvanja audiovizualne baštine koja je nezamjenjiv izvor za proučavanje i razumijevanje nacionalne povijesti, kulture i društvenoga života općenito.
Važan segment rada Hrvatske kinoteke je izdavaštvo, a s matičnom kućom, Hrvatskim državnim arhivom, Hrvatska kinoteka objavljuje knjige o hrvatskoj filmskoj povijesti kao dio serije pod naslovom Izvori za povijest hrvatskog filma i kinematografije. Pored toga izdaje i DVD izdanja s odabranim programima iz hrvatske filmske baštine koja je pritom digitalizirana i digitalno restaurirana, te na ovaj način ponovo predstavljena publici. Između ostaloga izdan je i najstariji sačuvani dugometražni igrani hrvatski film Lisinski Oktavijana Miletića iz 1943. godine, potom odabrani naslovi filmskih materijala o Zagrebu, Zagreb na filmu od 1915-1945, te kompilacija Oktavijan Miletić: AMATERSKI FILMOVI. Kinoteka sadržava i filmsku baštinu Nikše Fulgosija koja uključuje njegove filmove i pisane materijale poput scenarija i druge dokumentacije.
